Die Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter der Konstruktion sind zum einen für die hier gefertigten Neubauten zuständig, zum anderen für die in Papenburg und Turku konstruierten schwimmenden Maschinenraummodule (FERU‘s), die dort später in den Kreuzfahrtschiffen verbaut werden. Sie sind stets am gesamten Prozess beteiligt – an der Konzepterstellung, an der Kunden- und Klassegenehmigung, am Bauprozess und sogar über die Auslieferung hinaus bis zum Ende der Garantie. Zudem sind die Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter der Konstruktion für den Bereich der Betriebsmittelkonstruktion, der Transporte und der Verschleppungen zuständig. Sie konzipieren Hilfsmitteln, die für die Fertigstellung der Neubauten und der FERU‘s erforderlich sind, zum Beispiel Traversen mit Tragfähigkeiten von mehreren hundert Tonnen. Und sie planen innerbetriebliche Schwerlasttransporte und Verschiebungen auf dem Werftgelände. Auch die Vorbereitung und Betreuung der FERU-Verschleppungen zu den Werftstandorten in Papenburg und Turku gehören zum Aufgabengebiet der Betriebsmittelkonstruktion.

Die NEPTUN WERFT beschäftigt in der Konstruktion Menschen verschiedener Berufsgruppen, darunter auch Ingenieurinnen und Ingenieure.