Seit 1997 ist die NEPTUN WERFT Teil der MEYER WERFT Gruppe. Bis heute hat die Werft mehr als 70 Flusskreuzfahrtschiffe und diverse Fähren und Gastanker abgeliefert. Darüber hinaus werden hier in Rostock Maschinenraummodule für Kreuzfahrtschiffe der MEYER WERFT in Papenburg gebaut.

Die NEPTUN WERFT beschäftigt rund 600 Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter und gehört damit zu den wichtigsten Arbeitgebern in Rostock. Zudem gibt es hier rund 30 Auszubildende in drei verschiedenen Berufen.